ทั้งนี้ การที่กฎหมายกำหนดไว้เฉพาะกรณีหัวหน้าส่วนราชการเท่านั้น เนื่องจากจำเป็นจะต้องมี ผู้ที่ทำหน้าที่ดังกล่าว มิฉะนั้นย่อมเกิดความเสียหายต่องานราชการได้ และเมื่อมีการแต่งตั้งผู้รักษาราชการแทนหัวหน้าส่วนราชการแล้ว ผู้นั้นย่อมมีอำนาจและหน้าที่เช่นเดียวกับ ผู้ซึ่งตนแทน ในกรณีที่มีความจำเป็น ก็สามารถเสนอแต่งตั้งรองหัวหน้าส่วนราชการในระดับต่างๆ ได้ตามที่กฎหมายกำหนด โดยมิจำเป็นต้องแต่งตั้งผู้รักษาราชการแทนแต่อย่างใด และรองหัวหน้าส่วนราชการนั้นจะมีวาระการดำรงตำแหน่งเป็นไปตามวาระการดำรงตำแหน่งของผู้รักษาราชการแทนหัวหน้าส่วนราชการนั้น

อย่างไรก็ดี แม้ว่าตำแหน่งประเภทผู้บริหารระดับรองหัวหน้าส่วนราชการระดับคณะ กฎหมายจะบัญญัติให้อธิการบดีแต่งตั้งโดยคำแนะนำของหัวหน้าส่วนราชการระดับคณะ แต่ในกระบวนการพิจารณาเสนอแต่งตั้งนั้น จะต้องมีการตรวจสอบคุณสมบัติ และยังคงเป็นดุลพินิจของอธิการบดีที่จะพิจารณาความเหมาะสมของผู้ดำรงตำแหน่งได้ ดังนั้น การเข้าปฏิบัติหน้าที่ก่อนที่จะมีคำสั่งแต่งตั้ง จึงอาจก่อให้เกิดปัญหาในข้อกฎหมายหรือมีความสุ่มเสี่ยง ที่อาจเกิดกรณีปฏิบัติหน้าที่โดยมิชอบในภายหลังได้ หรือหากเป็นกรณีที่ผู้ได้รับแต่งตั้งยังไม่ได้เข้าปฏิบัติหน้าที่ แต่มีการออกคำสั่งย้อนหลังไปตามที่เสนอขอมา ก็อาจเกิดกรณีปัญหาการเบิกจ่ายเงินประจำตำแหน่งไม่ชอบด้วยกฎหมายได้เช่นกัน ซึ่งสถาบันอุดมศึกษาจะต้องพึงระมัดระวังมิให้เกิดกรณีการเบิกจ่ายเงินประจำตำแหน่งก่อนที่บุคคลนั้นจะเข้าปฏิบัติหน้าที่ในตำแหน่งที่มีสิทธิได้รับเงินประจำตำแหน่ง ซึ่งก็เป็นการพิสูจน์ได้ยากว่า บุคคลนั้นได้เข้าปฏิบัติหน้าที่ก่อนมีคำสั่งแต่งตั้งหรือไม่ จึงเป็นการปฏิบัติที่ไม่สมควรและไม่เป็นไปตามระเบียบแบบแผนของทางราชการ กรณีจึงไม่ควรมีการแต่งตั้งบุคคลให้ดำรงตำแหน่งย้อนหลังไปก่อนวันที่มีคำสั่งแต่งตั้ง